Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CT47A1Q5JQC4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CT47A1Q5JQC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms