Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC4Q5J8M3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC4Q5J8M3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms