Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRB2Q5IJ48 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB2Q5IJ48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms