Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTL5Q5HYW3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
RTL5Q5HYW3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTL5Q5HYW3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms