Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR3Q5GH77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR3Q5GH77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR3Q5GH77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.9 ms