Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIN4Q56A73 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIN4Q56A73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms