Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLE1Q53GS7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLE1Q53GS7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLE1Q53GS7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms