Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PHLDA2Q53GA4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms