Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFTN2Q52LD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms