Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1LQ52LC2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6AP1LQ52LC2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms