Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GGTA1PQ4G0N0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGTA1PQ4G0N0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGTA1PQ4G0N0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms