Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED5Q49AG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED5Q49AG3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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