Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF260Q3ZCT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF260Q3ZCT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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