Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLA2G4EQ3MJ16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G4EQ3MJ16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G4EQ3MJ16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G4EQ3MJ16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLA2G4EQ3MJ16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms