Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDRF1Q3B7T1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDRF1Q3B7T1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms