Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC57Q2TAC2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC57Q2TAC2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms