Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA3Q16787 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA3Q16787 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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