Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FOXD1Q16676 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FOXD1Q16676 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXD1Q16676 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXD1Q16676 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms