Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCBQ16585 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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