Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CRY1Q16526 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRY1Q16526 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms