Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VPS72Q15906 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VPS72Q15906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
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