Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB30Q15771 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB30Q15771 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB30Q15771 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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