Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRADDQ15628 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRADDQ15628 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms