Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGIF1Q15583 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGIF1Q15583 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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