Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF1Q15526 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SURF1Q15526 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms