Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRKQ15262 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRKQ15262 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
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