Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB3GAP1Q15042 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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