Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCA4Q14CN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA4Q14CN2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms