Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NR1I3Q14994 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR1I3Q14994 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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