Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS1Q14691 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS1Q14691 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS1Q14691 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms