Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNGB1Q14028 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGB1Q14028 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGB1Q14028 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
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