Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAE1Q13564 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAE1Q13564 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NAE1Q13564 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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