Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB3Q13509 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB3Q13509 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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