Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD4Q13485 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD4Q13485 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD4Q13485 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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