Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMS2P3Q13401 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMS2P3Q13401 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMS2P3Q13401 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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