Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CISD3-205ENST00000616128 773 ntTSL 217.69■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.885e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.935e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.255e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.955e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)19.7■□□□□ 0.745e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.645e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)18.51■□□□□ 0.555e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.395e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-17■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 RASSF5-206ENST00000581888 4499 ntTSL 211.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 RASSF5-203ENST00000579942 3279 ntTSL 29.68□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 26.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.279e-7■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 C9orf16-203ENST00000489240 573 ntTSL 321.04■□□□□ 0.968e-29■■■■■ 37.4
PABPC4Q13310 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 320.86■□□□□ 0.933e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 37.3
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PABPC4Q13310 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 37.3
PABPC4Q13310 APRT-206ENST00000567057 437 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-12■■■■■ 37.1
PABPC4Q13310 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-55■■■■■ 37
PABPC4Q13310 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-55■■■■■ 37
PABPC4Q13310 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-55■■■■■ 37
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PABPC4Q13310 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-55■■■■■ 37
PABPC4Q13310 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.626e-11■■■■■ 37
PABPC4Q13310 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 37
PABPC4Q13310 NDUFA3-213ENST00000484103 541 ntTSL 1 (best)23.31■■□□□ 1.328e-13■■■■■ 37
PABPC4Q13310 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.838e-13■■■■■ 37
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PABPC4Q13310 NDUFA3-205ENST00000417903 666 ntTSL 318.16■□□□□ 0.58e-13■■■■■ 37
PABPC4Q13310 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.488e-13■■■■■ 37
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PABPC4Q13310 NDUFA3-208ENST00000422029 694 ntTSL 313.8□□□□□ -0.28e-13■■■■■ 37
PABPC4Q13310 NDUFA3-209ENST00000451517 445 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.388e-13■■■■■ 37
PABPC4Q13310 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.658e-13■■■■■ 37
PABPC4Q13310 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 36.9
PABPC4Q13310 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 522.48■■□□□ 1.193e-35■■■■■ 36.9
PABPC4Q13310 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.473e-35■■■■■ 36.9
PABPC4Q13310 MIIP-204ENST00000478299 595 ntTSL 218.92■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 36.8
PABPC4Q13310 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 AK1-204ENST00000413016 525 ntTSL 514.58□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 523.61■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 LAMTOR1-203ENST00000535872 899 ntTSL 517.39■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 NEURL4-209ENST00000573186 4431 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 36.7
PABPC4Q13310 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 36.6
PABPC4Q13310 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 36.6
PABPC4Q13310 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-22■■■■■ 36.6
PABPC4Q13310 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.952e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.612e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.532e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-9■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-201ENST00000367883 706 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-212ENST00000495447 720 ntTSL 313.6□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MGST3-211ENST00000494074 772 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 MRPL58-203ENST00000583772 678 ntTSL 26.04□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 36.5
PABPC4Q13310 LGALS1-202ENST00000425542 637 ntTSL 322.66■■□□□ 1.221e-19■■■■■ 36.4
PABPC4Q13310 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-19■■■■■ 36.4
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