Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NME3Q13232 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME3Q13232 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME3Q13232 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME3Q13232 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME3Q13232 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME3Q13232 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME3Q13232 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME3Q13232 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME3Q13232 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME3Q13232 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME3Q13232 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME3Q13232 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME3Q13232 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME3Q13232 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME3Q13232 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME3Q13232 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME3Q13232 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME3Q13232 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME3Q13232 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME3Q13232 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME3Q13232 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME3Q13232 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME3Q13232 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME3Q13232 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME3Q13232 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME3Q13232 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME3Q13232 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME3Q13232 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME3Q13232 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME3Q13232 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME3Q13232 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME3Q13232 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME3Q13232 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME3Q13232 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME3Q13232 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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