Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
GRIN2BQ13224 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GRIN2BQ13224 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
GRIN2BQ13224 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
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