Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAF1AQ13111 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHAF1AQ13111 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAF1AQ13111 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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