Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL28Q13084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL28Q13084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL28Q13084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms