Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF1Q13077 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF1Q13077 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF1Q13077 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
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