Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIK3Q13003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms