Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH17Q12864 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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