Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCB1Q12824 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCB1Q12824 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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