Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNB2Q08289 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB2Q08289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms