Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN3Q08043 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN3Q08043 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms