Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL16A1Q07092 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL16A1Q07092 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL16A1Q07092 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
COL16A1Q07092 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms