Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKAP4Q07065 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP4Q07065 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP4Q07065 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms