Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCZQ05513 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCZQ05513 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCZQ05513 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms