Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT17Q04695 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms